Assassin's Creed 3 — это третья самостоятельная часть серии AC. Сюжет игры покажет завершение сюжетной линии Дезмонда Майлза в наши дни, и почти полную историю жизни нового героя — ассасина-индейца Коннора Кенуея, живущего в эпоху Американской революции.

Местом действия событий современности станет весь мир, т.к. Дезмонду предстоит разыскать шесть баз Тех-Кто-Пришел-Раньше, упомянутых им в финальной заставке Assassin's Creed: Revelations. События прошлого будут разворачиваться на территории Северной Америки в зоне между Нью-Йорком и Бостоном. Помимо этих двух городов в игре также будет возможность посетить лагеря колонистов в Лексингтоне и Конкорде, лагерь континентальной армии США в Кузнечной долине (Valley Forge), родную деревню Коннора, и еще множество иных мест. Кроме того, для исследований игроку будет предоставлена локация Пограничье (или Фронтир), имеющая территорию 1,5х1,5 км (что в полтора раза больше, чем территория Рима в AC:B).

Несмотря на то, что театром действий станет Американская революция, Коннор не будет бороться на стороне Британии или США. Assassin's Creed 3 покажет еще один эпизод в борьбе между Орденом Тамплиеров и Братством Ассасинов. При этом роль тамплиеров будет основательно пересмотрена сценаристами. "Мы не хотим показать тамплиеров плохими парнями", — говорят по этому поводу сами разработчики: "Они так же, как и ассасины борются за благо цивилизации, но выбирают для этого не совсем правильные методы."